Chargaffの法則は、あらゆる生物のあらゆる細胞からのDNAは1：1のピリミジン塩基とプリン塩基の比を持ち、より具体的にはグアニン、プリン塩基の量はシトシン、ピリミジン塩基と等しいと述べている。そして、プリン塩基であるアデニンの量は、ピリミジン塩基であるチミンに等しい。
それで塩基対はピリミジン塩基とプリン塩基からなる。このパターンはDNAの両方の鎖に見られ、アデニンは常にチミンと対になり、グアニンは常にシトシンと対になると述べている塩基対合則の原因となります。
窒素塩基は水素結合によって互いに対合する。