回答：
違いは含まれるDNAの鎖の数です。
説明：
複数の対立遺伝子では、同じDNA鎖が関与しています。例えば、血液型は同じDNA鎖に見られます。その鎖は、Ａ型タンパク質、Ｂ型タンパク質、またはタンパク質を含まないコード（Ｏ型血液）によって占められ得る。
多遺伝子遺伝は、DNAの複数の鎖に見られます。例えば、バクテリアや他の異物と戦うための抗生物質の形成は、DNA上の複数の場所に見られます。複数の場所で形成されたこれらのタンパク質片は、ほぼ無限の組み合わせで組み合わせることができます。これは免疫系が以前の遺伝的世代には存在しなかったかもしれない脅威に対応することを可能にする。
同様に、酵素タンパク質はＤＮＡの非連続部分から製造することができる。多遺伝子性生物であることは、新たな課題を解決するための酵素を生み出すことができます。驚くべき例はプラスチックを消化することができるいくつかのバクテリアの酵素の開発です。多遺伝子遺伝はほぼ無限の可能性をもたらします